圆二色光谱仪的工作原理是：利用蛋白质的圆二色性及不对称分子对左右圆偏振光吸收的不同来进行结构分析。蛋白质或多肽中主要的光活性基团是肽键、芳香氨基酸残基及二硫键等，当平面圆偏振光的吸收不相同时，会产生吸收差值。由于这种吸收差的存在，造成了偏振光矢量的振幅差，圆偏振光变成了椭圆偏振光，即蛋白质的圆二色性。通过圆二色谱扫描仪，可以在一定程度上分析蛋白质、多肽样品的二级结构和高级结构。

要测到准确的蛋白质CD谱，要同时看一看吸收谱，吸收值最好在0.5-2.0之间，这是最主要的参照标准，对浓度没有必然的规定，常见的经验值为浓度在0.1-1.0 mg/ml 之间， 也可以更低或更高。

圆二色谱分析的供试品，大多数情况下的蛋白质和多肽。蛋白质的精确浓度是计算样品二级结构的关键，一般要求样品浓度为0.2μg/μl，浓度过高，测试时信号不好，需稀释，样品纯度要在90%以上，不要添加任何保护剂或其它物质，样品中应避免含有光吸收的杂质，缓冲剂和溶剂在配制溶液前最好做单独的检查，透明性极好的磷酸盐可用作缓冲体系。

大连华洋分析仪器有限公司主营电化学工作站,微区扫描电化学工作站,多通道电化学工作站,作为较早将圆二色光谱技术引进国内的公司,华洋科仪始终以科学,严谨,专业,领先的形象得到国内外厂商以及客户的大力支持与信赖

圆二色谱在远紫外区的扫描图谱，反映的是蛋白质肽键的排布信息，计算所得的是蛋白质二级结构比例，即α-螺旋、β-折叠、转角和不规则卷曲的比例。

圆二色谱在近紫外区的扫描图谱，反映的是蛋白质侧链生色基团色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸等残基的排布信息和二硫键微环境的变化。